Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
RBL1P28749 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
RBL1P28749 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
RBL1P28749 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBL1P28749 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
RBL1P28749 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
RBL1P28749 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
RBL1P28749 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
RBL1P28749 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RBL1P28749 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBL1P28749 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBL1P28749 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RBL1P28749 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
RBL1P28749 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RBL1P28749 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
RBL1P28749 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms