Protein–RNA interactions for Protein: P28069

POU1F1, Pituitary-specific positive transcription factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POU1F1P28069 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
POU1F1P28069 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
POU1F1P28069 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
POU1F1P28069 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms