Protein–RNA interactions for Protein: P27694

RPA1, Replication protein A 70 kDa DNA-binding subunit, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA1P27694 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPA1P27694 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPA1P27694 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA1P27694 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA1P27694 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA1P27694 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA1P27694 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPA1P27694 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA1P27694 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA1P27694 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPA1P27694 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPA1P27694 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPA1P27694 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
RPA1P27694 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
RPA1P27694 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RPA1P27694 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RPA1P27694 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms