Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
NFKBIAP25963 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
NFKBIAP25963 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKBIAP25963 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
NFKBIAP25963 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms