Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMA4P25789 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMA4P25789 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms