Protein–RNA interactions for Protein: P24390

KDELR1, ER lumen protein-retaining receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDELR1P24390 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
KDELR1P24390 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
KDELR1P24390 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms