Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GCSHP23434 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GCSHP23434 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GCSHP23434 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GCSHP23434 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GCSHP23434 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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