Protein–RNA interactions for Protein: P23378

GLDC, Glycine dehydrogenase (decarboxylating), mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,020 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLDCP23378 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GLDCP23378 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GLDCP23378 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
GLDCP23378 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GLDCP23378 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GLDCP23378 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GLDCP23378 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GLDCP23378 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLDCP23378 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLDCP23378 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GLDCP23378 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLDCP23378 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GLDCP23378 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GLDCP23378 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GLDCP23378 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms