Protein–RNA interactions for Protein: P23327

HRC, Sarcoplasmic reticulum histidine-rich calcium-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRCP23327 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HRCP23327 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HRCP23327 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.91■■■■□ 3.18
HRCP23327 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
HRCP23327 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HRCP23327 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HRCP23327 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
HRCP23327 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC34.9■■■■□ 3.18
HRCP23327 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HRCP23327 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HRCP23327 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC34.89■■■■□ 3.18
HRCP23327 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HRCP23327 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
HRCP23327 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
HRCP23327 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
HRCP23327 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
HRCP23327 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
HRCP23327 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC34.85■■■■□ 3.17
HRCP23327 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HRCP23327 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
HRCP23327 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HRCP23327 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC34.85■■■■□ 3.17
HRCP23327 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
HRCP23327 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
HRCP23327 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC34.84■■■■□ 3.17
HRCP23327 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
HRCP23327 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
HRCP23327 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
HRCP23327 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.17
HRCP23327 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HRCP23327 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HRCP23327 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HRCP23327 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
HRCP23327 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
HRCP23327 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HRCP23327 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HRCP23327 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.81■■■■□ 3.16
HRCP23327 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
HRCP23327 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HRCP23327 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HRCP23327 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HRCP23327 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HRCP23327 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
HRCP23327 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
HRCP23327 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
HRCP23327 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HRCP23327 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
HRCP23327 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HRCP23327 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
HRCP23327 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
HRCP23327 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
HRCP23327 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
HRCP23327 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HRCP23327 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
HRCP23327 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
HRCP23327 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HRCP23327 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HRCP23327 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
HRCP23327 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HRCP23327 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
HRCP23327 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms