Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PTGS1P23219 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PTGS1P23219 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PTGS1P23219 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms