Protein–RNA interactions for Protein: P21912

SDHB, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHBP21912 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHBP21912 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHBP21912 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 RPS15-210ENST00000592623 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SDHBP21912 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 APTR-205ENST00000447009 902 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHBP21912 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHBP21912 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SDHBP21912 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SDHBP21912 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SDHBP21912 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
SDHBP21912 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SDHBP21912 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SDHBP21912 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHBP21912 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHBP21912 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHBP21912 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SDHBP21912 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms