Protein–RNA interactions for Protein: P20142

PGC, Gastricsin, humanhuman

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGCP20142 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
PGCP20142 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
PGCP20142 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
PGCP20142 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
PGCP20142 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
PGCP20142 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
PGCP20142 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
PGCP20142 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
PGCP20142 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
PGCP20142 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms