Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ERCC3P19447 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ERCC3P19447 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ERCC3P19447 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms