Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
XRCC1P18887 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
XRCC1P18887 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms