Protein–RNA interactions for Protein: P18850

ATF6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATF6P18850 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF6P18850 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ATF6P18850 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
ATF6P18850 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ATF6P18850 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF6P18850 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
ATF6P18850 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6P18850 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6P18850 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6P18850 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ATF6P18850 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF6P18850 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ATF6P18850 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6P18850 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6P18850 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6P18850 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6P18850 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ATF6P18850 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ATF6P18850 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.2 ms