Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CCL3L1P16619 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CCL3L1P16619 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms