Protein–RNA interactions for Protein: P15884

TCF4, Transcription factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF4P15884 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TCF4P15884 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TCF4P15884 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TCF4P15884 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TCF4P15884 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TCF4P15884 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF4P15884 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TCF4P15884 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TCF4P15884 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF4P15884 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF4P15884 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF4P15884 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TCF4P15884 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF4P15884 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF4P15884 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TCF4P15884 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF4P15884 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF4P15884 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TCF4P15884 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF4P15884 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF4P15884 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TCF4P15884 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TCF4P15884 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCF4P15884 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms