Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
HLA-EP13747 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HLA-EP13747 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HLA-EP13747 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms