Protein–RNA interactions for Protein: P13645

KRT10, Keratin, type I cytoskeletal 10, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT10P13645 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
KRT10P13645 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
KRT10P13645 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
KRT10P13645 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
KRT10P13645 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
KRT10P13645 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT10P13645 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
KRT10P13645 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
KRT10P13645 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
KRT10P13645 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms