Protein–RNA interactions for Protein: P13631

RARG, Retinoic acid receptor gamma, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARGP13631 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
RARGP13631 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
RARGP13631 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
RARGP13631 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARGP13631 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARGP13631 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARGP13631 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARGP13631 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARGP13631 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
RARGP13631 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
RARGP13631 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
RARGP13631 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARGP13631 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARGP13631 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARGP13631 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
RARGP13631 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
RARGP13631 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
RARGP13631 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARGP13631 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARGP13631 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARGP13631 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARGP13631 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARGP13631 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
RARGP13631 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
RARGP13631 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
RARGP13631 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
RARGP13631 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms