Protein–RNA interactions for Protein: P13611

VCAN, Versican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 3,396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VCANP13611 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
VCANP13611 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCANP13611 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.38
VCANP13611 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
VCANP13611 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCANP13611 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCANP13611 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCANP13611 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCANP13611 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
VCANP13611 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
VCANP13611 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
VCANP13611 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
VCANP13611 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
VCANP13611 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
VCANP13611 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VCANP13611 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCANP13611 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCANP13611 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCANP13611 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCANP13611 AC092143.4-201ENST00000570217 559 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VCANP13611 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCANP13611 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCANP13611 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
VCANP13611 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCANP13611 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCANP13611 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCANP13611 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCANP13611 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCANP13611 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VCANP13611 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VCANP13611 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms