Protein–RNA interactions for Protein: P13385

TDGF1, Teratocarcinoma-derived growth factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDGF1P13385 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TDGF1P13385 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TDGF1P13385 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TDGF1P13385 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms