Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CYP2C9P11712 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CYP2C9P11712 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms