Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRF1P10914 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
IRF1P10914 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
IRF1P10914 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF1P10914 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF1P10914 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF1P10914 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
IRF1P10914 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
IRF1P10914 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
IRF1P10914 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
IRF1P10914 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF1P10914 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF1P10914 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF1P10914 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF1P10914 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
IRF1P10914 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms