Protein–RNA interactions for Protein: P0DP42

TMEM225B, Transmembrane protein 225B, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM225BP0DP42 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
TMEM225BP0DP42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
TMEM225BP0DP42 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms