Protein–RNA interactions for Protein: P0DP01

IGHV1-8, Immunoglobulin heavy variable 1-8, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGHV1-8P0DP01 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
IGHV1-8P0DP01 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
IGHV1-8P0DP01 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms