Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW3

SMIM10L1, Small integral membrane protein 10-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L1P0DMW3 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SMIM10L1P0DMW3 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SMIM10L1P0DMW3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms