Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M4

RHOXF2B, Rhox homeobox family member 2B, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOXF2BP0C7M4 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
RHOXF2BP0C7M4 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
RHOXF2BP0C7M4 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
RHOXF2BP0C7M4 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms