Protein–RNA interactions for Protein: P09874

PARP1, Poly [ADP-ribose] polymerase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARP1P09874 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP1P09874 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP1P09874 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP1P09874 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP1P09874 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PARP1P09874 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PARP1P09874 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PARP1P09874 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PARP1P09874 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PARP1P09874 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PARP1P09874 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PARP1P09874 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PARP1P09874 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP1P09874 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP1P09874 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP1P09874 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PARP1P09874 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PARP1P09874 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms