Protein–RNA interactions for Protein: P08514

ITGA2B, Integrin alpha-IIb, humanhuman

Predictions only

Length 1,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2BP08514 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA2BP08514 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
ITGA2BP08514 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA2BP08514 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms