Protein–RNA interactions for Protein: P05976

MYL1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYL1P05976 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
MYL1P05976 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL1P05976 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL1P05976 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
MYL1P05976 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
MYL1P05976 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MYL1P05976 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL1P05976 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL1P05976 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL1P05976 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL1P05976 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL1P05976 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MYL1P05976 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
MYL1P05976 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MYL1P05976 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL1P05976 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MYL1P05976 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
MYL1P05976 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MYL1P05976 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYL1P05976 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYL1P05976 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MYL1P05976 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MYL1P05976 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms