Protein–RNA interactions for Protein: P02679

FGG, Fibrinogen gamma chain, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGGP02679 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
FGGP02679 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
FGGP02679 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
FGGP02679 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
FGGP02679 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
FGGP02679 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
FGGP02679 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
FGGP02679 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGGP02679 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGGP02679 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
FGGP02679 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
FGGP02679 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
FGGP02679 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FGGP02679 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 84.3 ms