Protein–RNA interactions for Protein: P02647

APOA1, Apolipoprotein A-I, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA1P02647 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
APOA1P02647 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
APOA1P02647 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
APOA1P02647 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
APOA1P02647 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
APOA1P02647 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms