Protein–RNA interactions for Protein: P01602

IGKV1-5, Immunoglobulin kappa variable 1-5, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-5P01602 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
IGKV1-5P01602 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
IGKV1-5P01602 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms