Protein–RNA interactions for Protein: O96011

PEX11B, Peroxisomal membrane protein 11B, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX11BO96011 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
PEX11BO96011 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PEX11BO96011 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PEX11BO96011 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms