Protein–RNA interactions for Protein: O94886

TMEM63A, CSC1-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 807 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM63AO94886 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
TMEM63AO94886 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TMEM63AO94886 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms