Protein–RNA interactions for Protein: O94759

TRPM2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPM2O94759 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC32.74■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC32.74■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.72■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
TRPM2O94759 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC32.67■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.66■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
TRPM2O94759 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
TRPM2O94759 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms