Protein–RNA interactions for Protein: O75935

DCTN3, Dynactin subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCTN3O75935 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DCTN3O75935 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DCTN3O75935 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.9 ms