Protein–RNA interactions for Protein: O75899

GABBR2, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR2O75899 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GABBR2O75899 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GABBR2O75899 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms