Protein–RNA interactions for Protein: O75473

LGR5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LGR5O75473 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LGR5O75473 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
LGR5O75473 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGR5O75473 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGR5O75473 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LGR5O75473 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LGR5O75473 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LGR5O75473 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LGR5O75473 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LGR5O75473 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
LGR5O75473 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
LGR5O75473 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms