Protein–RNA interactions for Protein: O75379

VAMP4, Vesicle-associated membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP4O75379 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
VAMP4O75379 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC28.85■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
VAMP4O75379 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAMP4O75379 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
VAMP4O75379 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms