Protein–RNA interactions for Protein: O75323

NIPSNAP2, Protein NipSnap homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP2O75323 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
NIPSNAP2O75323 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NIPSNAP2O75323 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms