Protein–RNA interactions for Protein: O75317

USP12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, humanhuman

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP12O75317 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP12O75317 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP12O75317 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP12O75317 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP12O75317 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP12O75317 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP12O75317 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP12O75317 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP12O75317 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP12O75317 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP12O75317 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP12O75317 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP12O75317 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP12O75317 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP12O75317 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
USP12O75317 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP12O75317 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP12O75317 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP12O75317 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP12O75317 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP12O75317 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP12O75317 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP12O75317 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms