Protein–RNA interactions for Protein: O60939

SCN2B, Sodium channel subunit beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN2BO60939 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SCN2BO60939 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN2BO60939 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN2BO60939 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
SCN2BO60939 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
SCN2BO60939 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SCN2BO60939 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
SCN2BO60939 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
SCN2BO60939 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
SCN2BO60939 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SCN2BO60939 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
SCN2BO60939 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SCN2BO60939 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms