Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CTSVO60911 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CTSVO60911 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CTSVO60911 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CTSVO60911 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CTSVO60911 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CTSVO60911 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CTSVO60911 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
CTSVO60911 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CTSVO60911 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms