Protein–RNA interactions for Protein: O60359

CACNG3, Voltage-dependent calcium channel gamma-3 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG3O60359 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CACNG3O60359 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG3O60359 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms