Protein–RNA interactions for Protein: O60303

KIAA0556, Protein KIAA0556, humanhuman

Predictions only

Length 1,618 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIAA0556O60303 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.37
KIAA0556O60303 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC36.04■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.02■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC36.01■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC36.01■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
KIAA0556O60303 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC36.01■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
KIAA0556O60303 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms