Protein–RNA interactions for Protein: O43719

HTATSF1, HIV Tat-specific factor 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTATSF1O43719 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC29.39■■■□□ 2.3
HTATSF1O43719 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
HTATSF1O43719 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
HTATSF1O43719 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms