Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
PRPF3O43395 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRPF3O43395 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms