Protein–RNA interactions for Protein: O43364

HOXA2, Homeobox protein Hox-A2, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA2O43364 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HOXA2O43364 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HOXA2O43364 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HOXA2O43364 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms